L'activité d'intégration en milieu hospitalier du certificat s'effectue au sein du service de génie biomédical d'un centre hospitalier. La nature du travail attendu de l'étudiant est approuvée conjointement par le coordonnateur et le service de génie biomédical qui reçoit. Le centre hospitalier doit identifier une personne responsable de l'encadrement de l'étudiant qui travaillera en étroite collaboration avec le coordonnateur (professeur responsable du cours). L'étudiant devra rédiger un carnet de bord hebdomadaire, un rapport d'étape et un rapport final.